Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Olfr6-203ENSMUST00000213651 4457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Aoc1-201ENSMUST00000031835 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Epn2-203ENSMUST00000108712 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Dhtkd1-201ENSMUST00000026924 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Spata31d1a-201ENSMUST00000066510 4261 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Sik2-206ENSMUST00000176824 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa8P50706 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa8P50706 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa8P50706 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Cfap43-202ENSMUST00000095998 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa8P50706 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Ccdc40-201ENSMUST00000035935 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Lhx9-201ENSMUST00000019374 4937 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Clip3-201ENSMUST00000014065 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa8P50706 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa8P50706 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Defa8P50706 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms