Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ggta1P23336 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms