Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Tcaf1-202ENSMUST00000045140 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pou4f1P17208 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms