Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl20O89093 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms