Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q8

Clec4e, C-type lectin domain family 4 member E, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4eQ9R0Q8 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Clec4eQ9R0Q8 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Clec4eQ9R0Q8 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Clec4eQ9R0Q8 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Clec4eQ9R0Q8 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Clec4eQ9R0Q8 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Clec4eQ9R0Q8 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Clec4eQ9R0Q8 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Clec4eQ9R0Q8 Wnk1-204ENSMUST00000088646 8364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Clec4eQ9R0Q8 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Clec4eQ9R0Q8 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Clec4eQ9R0Q8 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Clec4eQ9R0Q8 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Clec4eQ9R0Q8 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Clec4eQ9R0Q8 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Clec4eQ9R0Q8 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Clec4eQ9R0Q8 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Clec4eQ9R0Q8 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Clec4eQ9R0Q8 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Clec4eQ9R0Q8 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Clec4eQ9R0Q8 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Clec4eQ9R0Q8 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Clec4eQ9R0Q8 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Clec4eQ9R0Q8 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Clec4eQ9R0Q8 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Clec4eQ9R0Q8 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Clec4eQ9R0Q8 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Clec4eQ9R0Q8 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Clec4eQ9R0Q8 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Clec4eQ9R0Q8 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Clec4eQ9R0Q8 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Clec4eQ9R0Q8 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Clec4eQ9R0Q8 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Clec4eQ9R0Q8 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Clec4eQ9R0Q8 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Clec4eQ9R0Q8 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Clec4eQ9R0Q8 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Clec4eQ9R0Q8 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Clec4eQ9R0Q8 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Clec4eQ9R0Q8 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Clec4eQ9R0Q8 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Clec4eQ9R0Q8 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Clec4eQ9R0Q8 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Clec4eQ9R0Q8 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Clec4eQ9R0Q8 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Clec4eQ9R0Q8 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Clec4eQ9R0Q8 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Clec4eQ9R0Q8 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Clec4eQ9R0Q8 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Clec4eQ9R0Q8 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Clec4eQ9R0Q8 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Clec4eQ9R0Q8 1700019J19Rik-205ENSMUST00000216531 2813 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Clec4eQ9R0Q8 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Clec4eQ9R0Q8 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Clec4eQ9R0Q8 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Clec4eQ9R0Q8 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Clec4eQ9R0Q8 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Clec4eQ9R0Q8 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Clec4eQ9R0Q8 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Clec4eQ9R0Q8 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Clec4eQ9R0Q8 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Clec4eQ9R0Q8 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Clec4eQ9R0Q8 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Clec4eQ9R0Q8 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Clec4eQ9R0Q8 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Clec4eQ9R0Q8 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Clec4eQ9R0Q8 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Clec4eQ9R0Q8 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Clec4eQ9R0Q8 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Clec4eQ9R0Q8 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Clec4eQ9R0Q8 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Clec4eQ9R0Q8 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Clec4eQ9R0Q8 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Clec4eQ9R0Q8 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Clec4eQ9R0Q8 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Clec4eQ9R0Q8 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Clec4eQ9R0Q8 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Clec4eQ9R0Q8 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Clec4eQ9R0Q8 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Clec4eQ9R0Q8 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Clec4eQ9R0Q8 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Clec4eQ9R0Q8 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Clec4eQ9R0Q8 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Clec4eQ9R0Q8 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Clec4eQ9R0Q8 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Clec4eQ9R0Q8 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Clec4eQ9R0Q8 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Clec4eQ9R0Q8 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Clec4eQ9R0Q8 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Clec4eQ9R0Q8 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Clec4eQ9R0Q8 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Clec4eQ9R0Q8 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Clec4eQ9R0Q8 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Clec4eQ9R0Q8 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Clec4eQ9R0Q8 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Clec4eQ9R0Q8 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Clec4eQ9R0Q8 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Clec4eQ9R0Q8 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Clec4eQ9R0Q8 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Clec4eQ9R0Q8 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms