Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Gk2-201ENSMUST00000059657 1880 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 4933439C10Rik-203ENSMUST00000132226 3184 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Btrc-206ENSMUST00000224102 3037 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Nlrx1-201ENSMUST00000034621 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Rab27a-201ENSMUST00000034722 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Lrrc61-202ENSMUST00000114545 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Oprl1-205ENSMUST00000108768 2914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Wars-205ENSMUST00000161410 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Agbl2-201ENSMUST00000037206 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Inpp4a-205ENSMUST00000132401 3234 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Ly9-203ENSMUST00000111277 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 5430434F05Rik-201ENSMUST00000206080 3553 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Wdr78-201ENSMUST00000036451 3671 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Anxa7-207ENSMUST00000224975 2727 ntAPPRIS P2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Cfap61-204ENSMUST00000126415 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Zscan21-203ENSMUST00000110959 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Atp6v0a4-201ENSMUST00000040259 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Tesk2-202ENSMUST00000106456 2430 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Slc35c1-201ENSMUST00000067631 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms