Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Lrrtm2Q8BGA3 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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