Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Gpatch1-201ENSMUST00000079693 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Gas7-202ENSMUST00000108680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Stmn3-201ENSMUST00000103045 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Ighv1-56-201ENSMUST00000103527 294 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Psme2-201ENSMUST00000111378 795 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Rab29-202ENSMUST00000112386 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 4930529I22Rik-201ENSMUST00000131509 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Gm17107-201ENSMUST00000170983 553 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Galntl5-201ENSMUST00000030778 1627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Mettl18-202ENSMUST00000111490 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Gm45170-201ENSMUST00000206746 1671 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Efna1-201ENSMUST00000029566 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Capns1-202ENSMUST00000108196 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Klra9-202ENSMUST00000112032 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Tpm1-205ENSMUST00000113685 1208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Gm14633-201ENSMUST00000121152 470 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Gm15373-201ENSMUST00000121495 214 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Vmn2r-ps13-201ENSMUST00000176920 606 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Fut1-202ENSMUST00000209379 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Rps14-201ENSMUST00000025511 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Klra9-201ENSMUST00000071554 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Gm17541-201ENSMUST00000080062 525 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Gm8618-201ENSMUST00000097570 432 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Gm32914-201ENSMUST00000203815 2228 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Pfn4-202ENSMUST00000178879 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Scmh1-203ENSMUST00000106298 1995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Dytn-201ENSMUST00000090313 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Atp5s-201ENSMUST00000021372 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Tcl1b4-202ENSMUST00000222867 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Mrpl24-202ENSMUST00000119968 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Gm15793-201ENSMUST00000121857 495 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Gm16283-201ENSMUST00000149935 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Gm43821-201ENSMUST00000199198 729 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 4933407I05Rik-202ENSMUST00000213467 420 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 AC132384.2-201ENSMUST00000218018 526 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 AC118639.1-202ENSMUST00000226957 653 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Tbata-202ENSMUST00000079235 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Gm43625-201ENSMUST00000199177 1539 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Dcstamp-201ENSMUST00000022913 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Ccdc42-202ENSMUST00000102612 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Gm15489-201ENSMUST00000132811 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Gm27675-201ENSMUST00000184527 94 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 1700048F04Rik-201ENSMUST00000199057 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Gm33570-201ENSMUST00000207608 1254 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 AC161052.1-201ENSMUST00000222856 910 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Gm4778-201ENSMUST00000098878 1098 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Top2aQ01320 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms