Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 AC156790.2-201ENSMUST00000227115 568 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Hoxd13P70217 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Hoxd13P70217 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
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