Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rps29P62274 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
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