Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LtbrP50284 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LtbrP50284 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbrP50284 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Gm15719-201ENSMUST00000120619 635 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Bola3-203ENSMUST00000122216 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Vmn1r169-201ENSMUST00000170290 915 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbrP50284 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Gm42947-201ENSMUST00000198230 675 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbrP50284 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Olfr282-204ENSMUST00000215320 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtbrP50284 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtbrP50284 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Gm23604-201ENSMUST00000104311 132 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtbrP50284 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Gm12278-201ENSMUST00000153718 407 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
LtbrP50284 9930120I10Rik-201ENSMUST00000203027 865 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Gm34701-201ENSMUST00000204213 849 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Gm4803-201ENSMUST00000218729 1279 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Gm17611-202ENSMUST00000220613 814 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Trappc3l-201ENSMUST00000095758 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LtbrP50284 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LtbrP50284 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
LtbrP50284 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
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