Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Lnx1O70263 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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