Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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Ssxb8B1AY40 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Ssxb8B1AY40 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Ssxb8B1AY40 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Ssxb8B1AY40 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Ssxb8B1AY40 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Ssxb8B1AY40 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Ssxb8B1AY40 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssxb8B1AY40 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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