Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3173A6NAS3 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3173A6NAS3 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3173A6NAS3 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3173A6NAS3 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3173A6NAS3 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3173A6NAS3 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3173A6NAS3 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3173A6NAS3 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3173A6NAS3 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3173A6NAS3 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Gm3173A6NAS3 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Gm3173A6NAS3 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3173A6NAS3 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3173A6NAS3 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3173A6NAS3 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3173A6NAS3 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Gm3173A6NAS3 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3173A6NAS3 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3173A6NAS3 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3173A6NAS3 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3173A6NAS3 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3173A6NAS3 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Gm3173A6NAS3 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3173A6NAS3 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3173A6NAS3 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3173A6NAS3 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3173A6NAS3 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3173A6NAS3 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3173A6NAS3 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Gm3173A6NAS3 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Gm3173A6NAS3 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3173A6NAS3 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3173A6NAS3 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3173A6NAS3 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3173A6NAS3 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Gm3173A6NAS3 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm3173A6NAS3 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Gm3173A6NAS3 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm3173A6NAS3 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm3173A6NAS3 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3173A6NAS3 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Gm3173A6NAS3 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Gm3173A6NAS3 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Gm3173A6NAS3 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Gm3173A6NAS3 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3173A6NAS3 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3173A6NAS3 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
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Gm3173A6NAS3 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3173A6NAS3 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3173A6NAS3 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3173A6NAS3 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3173A6NAS3 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3173A6NAS3 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3173A6NAS3 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3173A6NAS3 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3173A6NAS3 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3173A6NAS3 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3173A6NAS3 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3173A6NAS3 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3173A6NAS3 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3173A6NAS3 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3173A6NAS3 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3173A6NAS3 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3173A6NAS3 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms