Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sema6cQ9WTM3 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms