Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC9

Gnpda2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda2Q9CRC9 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gnpda2Q9CRC9 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gnpda2Q9CRC9 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms