Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPU1

Ssxb1, MCG116417, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb1Q9CPU1 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Ssxb1Q9CPU1 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Ssxb1Q9CPU1 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Ssxb1Q9CPU1 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Ssxb1Q9CPU1 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ssxb1Q9CPU1 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssxb1Q9CPU1 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssxb1Q9CPU1 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssxb1Q9CPU1 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssxb1Q9CPU1 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssxb1Q9CPU1 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssxb1Q9CPU1 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssxb1Q9CPU1 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssxb1Q9CPU1 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssxb1Q9CPU1 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ssxb1Q9CPU1 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
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