Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
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Ciao1Q99KN2 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Ciao1Q99KN2 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Ciao1Q99KN2 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Ciao1Q99KN2 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Ciao1Q99KN2 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Ciao1Q99KN2 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Ciao1Q99KN2 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Ciao1Q99KN2 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Ciao1Q99KN2 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Ciao1Q99KN2 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ciao1Q99KN2 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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