Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccser1Q8C0C4 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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