Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Gm6740-201ENSMUST00000100617 864 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Gm27444-201ENSMUST00000184157 137 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Gm15815-201ENSMUST00000120569 255 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmeff1Q6PFE7 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
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