Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox8Q04886 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Sox8Q04886 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Sox8Q04886 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sox8Q04886 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Sox8Q04886 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sox8Q04886 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sox8Q04886 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sox8Q04886 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sox8Q04886 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox8Q04886 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox8Q04886 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox8Q04886 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox8Q04886 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox8Q04886 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox8Q04886 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox8Q04886 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox8Q04886 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox8Q04886 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox8Q04886 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox8Q04886 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox8Q04886 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox8Q04886 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox8Q04886 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox8Q04886 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox8Q04886 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox8Q04886 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox8Q04886 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox8Q04886 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox8Q04886 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox8Q04886 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox8Q04886 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox8Q04886 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox8Q04886 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Sox8Q04886 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox8Q04886 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox8Q04886 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox8Q04886 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Sox8Q04886 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Sox8Q04886 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox8Q04886 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox8Q04886 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox8Q04886 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox8Q04886 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox8Q04886 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox8Q04886 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox8Q04886 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox8Q04886 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox8Q04886 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox8Q04886 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox8Q04886 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox8Q04886 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox8Q04886 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox8Q04886 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox8Q04886 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox8Q04886 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox8Q04886 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox8Q04886 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox8Q04886 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox8Q04886 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox8Q04886 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox8Q04886 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox8Q04886 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox8Q04886 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox8Q04886 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox8Q04886 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox8Q04886 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox8Q04886 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox8Q04886 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms