Protein–RNA interactions for Protein: P06800

Ptprc, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, mousemouse

Predictions only

Length 1,291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprcP06800 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprcP06800 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprcP06800 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
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PtprcP06800 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprcP06800 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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PtprcP06800 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprcP06800 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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PtprcP06800 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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PtprcP06800 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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PtprcP06800 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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PtprcP06800 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprcP06800 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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PtprcP06800 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprcP06800 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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PtprcP06800 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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PtprcP06800 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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PtprcP06800 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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PtprcP06800 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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PtprcP06800 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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PtprcP06800 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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PtprcP06800 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprcP06800 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprcP06800 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprcP06800 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprcP06800 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprcP06800 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprcP06800 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprcP06800 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprcP06800 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprcP06800 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprcP06800 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprcP06800 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprcP06800 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprcP06800 Mir670hg-205ENSMUST00000210851 1148 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprcP06800 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprcP06800 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprcP06800 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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PtprcP06800 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms