Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Spata16-201ENSMUST00000047005 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Zfp780b-201ENSMUST00000081618 3004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Gm26625-201ENSMUST00000181519 2538 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Gm32219-201ENSMUST00000221234 1819 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Mfsd2b-201ENSMUST00000045921 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Exoc4-202ENSMUST00000090381 2598 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Dusp16-202ENSMUST00000129433 3993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Gm44798-201ENSMUST00000208123 2410 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Echdc1-201ENSMUST00000020034 3856 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Clip3-201ENSMUST00000014065 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Exoc7-203ENSMUST00000106413 3298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Mre11a-201ENSMUST00000034405 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Nlrx1-201ENSMUST00000034621 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 4632418H02Rik-201ENSMUST00000217287 2721 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ChmQ9QXG2 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms