Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mrpl4Q9DCU6 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms