Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

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Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Dpf3P58269 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Dpf3P58269 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Dpf3P58269 1110034G24Rik-201ENSMUST00000061891 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dpf3P58269 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Dpf3P58269 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Dpf3P58269 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Dpf3P58269 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Dpf3P58269 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Dpf3P58269 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Dpf3P58269 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
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Dpf3P58269 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Dpf3P58269 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Dpf3P58269 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Dpf3P58269 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Dpf3P58269 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dpf3P58269 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Dpf3P58269 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dpf3P58269 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Dpf3P58269 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Dpf3P58269 Cd300ld5-201ENSMUST00000100239 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Dpf3P58269 Gm7849-201ENSMUST00000110752 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Dpf3P58269 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dpf3P58269 Gm42375-201ENSMUST00000206226 745 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Dpf3P58269 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Dpf3P58269 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dpf3P58269 Cd300ld3-201ENSMUST00000092459 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dpf3P58269 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dpf3P58269 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dpf3P58269 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dpf3P58269 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dpf3P58269 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dpf3P58269 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dpf3P58269 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Dpf3P58269 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dpf3P58269 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Dpf3P58269 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Dpf3P58269 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dpf3P58269 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dpf3P58269 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dpf3P58269 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dpf3P58269 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
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