Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
P20040 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
P20040 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P20040 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
P20040 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P20040 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P20040 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P20040 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P20040 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P20040 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P20040 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P20040 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
P20040 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
P20040 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P20040 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P20040 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
P20040 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P20040 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P20040 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
P20040 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P20040 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P20040 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P20040 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P20040 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P20040 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P20040 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P20040 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P20040 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P20040 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P20040 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P20040 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P20040 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P20040 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P20040 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P20040 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P20040 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P20040 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P20040 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P20040 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P20040 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P20040 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P20040 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P20040 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P20040 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P20040 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P20040 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P20040 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P20040 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
P20040 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P20040 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P20040 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
P20040 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
P20040 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
P20040 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
P20040 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
P20040 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P20040 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
P20040 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
P20040 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
P20040 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P20040 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P20040 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
P20040 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P20040 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
P20040 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P20040 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P20040 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P20040 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P20040 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P20040 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P20040 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P20040 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P20040 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P20040 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P20040 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P20040 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P20040 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P20040 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P20040 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P20040 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P20040 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P20040 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P20040 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
P20040 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P20040 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P20040 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P20040 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P20040 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P20040 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P20040 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P20040 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
P20040 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P20040 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P20040 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P20040 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P20040 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P20040 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P20040 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P20040 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
P20040 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
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