Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TtrP07309 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TtrP07309 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TtrP07309 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TtrP07309 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TtrP07309 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TtrP07309 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TtrP07309 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TtrP07309 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TtrP07309 Fermt1-201ENSMUST00000038280 4915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TtrP07309 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TtrP07309 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TtrP07309 Clic5-201ENSMUST00000024755 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TtrP07309 Gcc2-201ENSMUST00000057659 6547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TtrP07309 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TtrP07309 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TtrP07309 Arid1b-203ENSMUST00000115799 9888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
TtrP07309 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TtrP07309 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
TtrP07309 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 Zfp532-201ENSMUST00000049016 5503 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 Acbd5-212ENSMUST00000227663 4566 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 Rnf43-202ENSMUST00000092800 4037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 Kcnj15-206ENSMUST00000113859 5046 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 Gtf2i-222ENSMUST00000174354 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 Pcdh18-202ENSMUST00000191794 5146 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 Ldlr-201ENSMUST00000034713 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 Npc1l1-201ENSMUST00000004505 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 Synpo2-203ENSMUST00000106427 6937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 Txndc16-205ENSMUST00000139526 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 Sf3b5-201ENSMUST00000105139 3841 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 Efna5-201ENSMUST00000076840 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
TtrP07309 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
TtrP07309 AC154352.1-201ENSMUST00000221477 2365 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms