Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssxb8B1AY40 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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