Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 5031425E22Rik-202ENSMUST00000185943 1477 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm4930-201ENSMUST00000219926 1087 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 AC154354.1-203ENSMUST00000225565 1364 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Teddm3-201ENSMUST00000170665 1346 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Lgr5Q9Z1P4 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Lgr5Q9Z1P4 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Focad-202ENSMUST00000107147 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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