Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 Decr1-201ENSMUST00000029877 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 Nkap-201ENSMUST00000016553 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 Mgme1-201ENSMUST00000028910 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 Ctsa-202ENSMUST00000103092 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 AC115746.1-201ENSMUST00000228949 3617 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 Gpm6b-206ENSMUST00000112228 3083 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 2810029C07Rik-201ENSMUST00000180698 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 Kif3a-202ENSMUST00000118353 2178 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 Gm28138-201ENSMUST00000186250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 Gm29270-201ENSMUST00000188071 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 Gm29392-201ENSMUST00000189429 2167 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 Gm29252-201ENSMUST00000189869 2167 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 Gm29305-201ENSMUST00000191054 2167 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 Smad2-201ENSMUST00000025453 2410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 Gpr68-202ENSMUST00000110065 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 Fam122b-201ENSMUST00000071023 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 Nedd1-201ENSMUST00000020163 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 Ilf3-204ENSMUST00000213603 3430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 Extl1-201ENSMUST00000030643 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 Limch1-202ENSMUST00000101164 5192 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 Aqp7-202ENSMUST00000054945 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 Hsp90aa1-202ENSMUST00000094361 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 Kat7-204ENSMUST00000107733 3470 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nmd3Q99L48 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Nmd3Q99L48 N4bp2l1-205ENSMUST00000202031 1864 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Nmd3Q99L48 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Nmd3Q99L48 Pantr1-208ENSMUST00000181660 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Nmd3Q99L48 Bpifb9a-201ENSMUST00000088924 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Nmd3Q99L48 Oprm1-213ENSMUST00000105604 1616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Nmd3Q99L48 Wdr37-212ENSMUST00000176922 3780 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Nmd3Q99L48 Ctc1-211ENSMUST00000161455 3989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Nmd3Q99L48 Zbtb8b-202ENSMUST00000106046 3323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Nmd3Q99L48 Acan-201ENSMUST00000032835 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Nmd3Q99L48 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Nmd3Q99L48 Tnfaip1-201ENSMUST00000017759 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Nmd3Q99L48 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nmd3Q99L48 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nmd3Q99L48 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nmd3Q99L48 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Nmd3Q99L48 Park2-209ENSMUST00000191124 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nmd3Q99L48 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nmd3Q99L48 Sbno2-201ENSMUST00000042771 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nmd3Q99L48 9630001P10Rik-201ENSMUST00000181083 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nmd3Q99L48 Rbm10-203ENSMUST00000084383 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nmd3Q99L48 Slc12a5-209ENSMUST00000202623 3574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nmd3Q99L48 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Nmd3Q99L48 Pmel-201ENSMUST00000054125 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nmd3Q99L48 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nmd3Q99L48 2310065F04Rik-201ENSMUST00000125538 2724 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nmd3Q99L48 Fam217a-202ENSMUST00000223834 2253 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nmd3Q99L48 Gm37975-201ENSMUST00000195494 2099 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms