Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgap45-202ENSMUST00000099501 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Dgcr2-201ENSMUST00000012152 4045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Ank1-205ENSMUST00000117296 6794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 N6amt1-204ENSMUST00000120284 3473 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Tomm20-201ENSMUST00000179857 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppm1f-201ENSMUST00000027373 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Parp1-201ENSMUST00000027777 3873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Tti2-201ENSMUST00000098842 5039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Hmbox1-201ENSMUST00000022544 3396 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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D13Ertd608eQ3UPR8 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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D13Ertd608eQ3UPR8 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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D13Ertd608eQ3UPR8 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptk2b-202ENSMUST00000089250 3903 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm29125-201ENSMUST00000187121 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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D13Ertd608eQ3UPR8 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Lhx9-201ENSMUST00000019374 4937 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Sik2-206ENSMUST00000176824 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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D13Ertd608eQ3UPR8 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
D13Ertd608eQ3UPR8 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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