Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Ndrg4-201ENSMUST00000041318 3101 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Dcaf12l1-201ENSMUST00000060481 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Gm29125-201ENSMUST00000187121 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Gphn-201ENSMUST00000052472 3570 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skap2Q3UND0 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 4933439C10Rik-203ENSMUST00000132226 3184 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Clip3-201ENSMUST00000014065 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skap2Q3UND0 Sf3b5-201ENSMUST00000105139 3841 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms