Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V2

Tradd, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TraddQ3U0V2 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 P4ha1-201ENSMUST00000009789 4043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 Kif2b-201ENSMUST00000061019 2244 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 Prdx6-202ENSMUST00000071718 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 Gm9220-201ENSMUST00000190721 2544 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 Itgax-201ENSMUST00000033053 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 D2hgdh-202ENSMUST00000112881 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 Dpf2-205ENSMUST00000136983 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 Gm38169-201ENSMUST00000191822 2539 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 Eno2-202ENSMUST00000112476 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 Fgd4-204ENSMUST00000161188 2214 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 5730460C07Rik-201ENSMUST00000081193 1834 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 Clcn1-201ENSMUST00000031894 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TraddQ3U0V2 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Dhcr7-202ENSMUST00000124340 2556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 R3hdm2-218ENSMUST00000170336 3639 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Gm37975-201ENSMUST00000195494 2099 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Gm45768-201ENSMUST00000206763 3202 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Prkcd-208ENSMUST00000112211 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Gm43517-201ENSMUST00000110746 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Lipg-201ENSMUST00000066532 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Gm16387-201ENSMUST00000180990 2632 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TraddQ3U0V2 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms