Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
NfiaQ02780 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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NfiaQ02780 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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NfiaQ02780 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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NfiaQ02780 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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NfiaQ02780 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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NfiaQ02780 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
NfiaQ02780 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms