Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Rhobtb1-201ENSMUST00000020101 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx1P81068 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx1P81068 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Tsix-202ENSMUST00000211291 3263 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx1P81068 P3h1-202ENSMUST00000081606 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Ddr1-203ENSMUST00000117301 3874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Gm37307-201ENSMUST00000193663 2621 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Gabra5-203ENSMUST00000206734 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Apobec3-204ENSMUST00000175714 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Cd1d1-201ENSMUST00000029717 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Zfp943-201ENSMUST00000055349 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx1P81068 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
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Irx1P81068 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx1P81068 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx1P81068 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Gm38169-201ENSMUST00000191822 2539 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx1P81068 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Irx1P81068 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Tmem184b-205ENSMUST00000228002 3315 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Loxl4-201ENSMUST00000026190 3738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Ndrg4-201ENSMUST00000041318 3101 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Irx1P81068 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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