Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CitP49025 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
CitP49025 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CitP49025 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CitP49025 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CitP49025 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CitP49025 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CitP49025 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CitP49025 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CitP49025 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CitP49025 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CitP49025 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CitP49025 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CitP49025 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CitP49025 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CitP49025 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CitP49025 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CitP49025 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CitP49025 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CitP49025 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CitP49025 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CitP49025 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CitP49025 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CitP49025 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CitP49025 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CitP49025 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CitP49025 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CitP49025 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CitP49025 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CitP49025 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CitP49025 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CitP49025 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CitP49025 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CitP49025 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CitP49025 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CitP49025 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CitP49025 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CitP49025 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CitP49025 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CitP49025 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CitP49025 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CitP49025 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CitP49025 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CitP49025 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CitP49025 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CitP49025 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CitP49025 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CitP49025 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CitP49025 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CitP49025 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CitP49025 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CitP49025 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CitP49025 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CitP49025 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CitP49025 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CitP49025 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CitP49025 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CitP49025 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CitP49025 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CitP49025 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CitP49025 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CitP49025 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CitP49025 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CitP49025 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CitP49025 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CitP49025 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CitP49025 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CitP49025 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CitP49025 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CitP49025 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CitP49025 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CitP49025 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CitP49025 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CitP49025 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CitP49025 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CitP49025 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CitP49025 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CitP49025 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CitP49025 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CitP49025 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CitP49025 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CitP49025 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CitP49025 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CitP49025 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CitP49025 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CitP49025 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CitP49025 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CitP49025 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CitP49025 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CitP49025 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CitP49025 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CitP49025 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
CitP49025 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
CitP49025 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
CitP49025 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
CitP49025 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
CitP49025 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
CitP49025 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CitP49025 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CitP49025 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms