Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gm20939L7N243 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm20939L7N243 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 263.3 ms