Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pole3Q9JKP7 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pole3Q9JKP7 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pole3Q9JKP7 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pole3Q9JKP7 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pole3Q9JKP7 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pole3Q9JKP7 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pole3Q9JKP7 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pole3Q9JKP7 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pole3Q9JKP7 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pole3Q9JKP7 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pole3Q9JKP7 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pole3Q9JKP7 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pole3Q9JKP7 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pole3Q9JKP7 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pole3Q9JKP7 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pole3Q9JKP7 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pole3Q9JKP7 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pole3Q9JKP7 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pole3Q9JKP7 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pole3Q9JKP7 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pole3Q9JKP7 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pole3Q9JKP7 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pole3Q9JKP7 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pole3Q9JKP7 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pole3Q9JKP7 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pole3Q9JKP7 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pole3Q9JKP7 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pole3Q9JKP7 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pole3Q9JKP7 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pole3Q9JKP7 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pole3Q9JKP7 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pole3Q9JKP7 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pole3Q9JKP7 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pole3Q9JKP7 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Pole3Q9JKP7 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pole3Q9JKP7 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pole3Q9JKP7 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pole3Q9JKP7 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pole3Q9JKP7 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pole3Q9JKP7 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Pole3Q9JKP7 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pole3Q9JKP7 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Pole3Q9JKP7 Plec-215ENSMUST00000169108 14853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pole3Q9JKP7 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pole3Q9JKP7 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pole3Q9JKP7 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pole3Q9JKP7 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Pole3Q9JKP7 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Aebp2-201ENSMUST00000032359 5932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Il9r-205ENSMUST00000145401 4482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Ryr1-202ENSMUST00000179893 15358 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pole3Q9JKP7 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms