Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Dsg1bQ7TSF1 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Dsg1bQ7TSF1 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Dsg1bQ7TSF1 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Dsg1bQ7TSF1 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
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Dsg1bQ7TSF1 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Dsg1bQ7TSF1 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Dsg1bQ7TSF1 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Dsg1bQ7TSF1 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Dsg1bQ7TSF1 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Dsg1bQ7TSF1 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Dsg1bQ7TSF1 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Dsg1bQ7TSF1 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Dsg1bQ7TSF1 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms