Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pkp4Q68FH0 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms