Protein–RNA interactions for Protein: Q62059

Vcan, Versican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcanQ62059 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Gm44767-201ENSMUST00000206634 469 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Gzmf-201ENSMUST00000022757 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Olfr578-201ENSMUST00000056235 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Kif16b-203ENSMUST00000211861 4523 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Zdhhc9-201ENSMUST00000037960 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VcanQ62059 1700048O20Rik-202ENSMUST00000214777 1900 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Gm5046-201ENSMUST00000100608 611 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Gm9434-201ENSMUST00000118975 813 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Gm12817-201ENSMUST00000119622 610 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
VcanQ62059 4933439K11Rik-202ENSMUST00000140307 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VcanQ62059 5730420D15Rik-201ENSMUST00000181781 1182 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Gm9553-201ENSMUST00000185703 996 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Gm6008-201ENSMUST00000206542 874 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
VcanQ62059 AC170810.2-201ENSMUST00000228384 1232 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Olfr1419-201ENSMUST00000087857 1160 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Rangap1-203ENSMUST00000171115 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Dcaf12l1-201ENSMUST00000060481 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Ddias-201ENSMUST00000032877 3387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Gm12529-201ENSMUST00000119529 268 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Gzmg-201ENSMUST00000015578 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Gm30652-201ENSMUST00000199103 430 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Gm43165-201ENSMUST00000200842 1635 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Sh3glb1-204ENSMUST00000199531 2584 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VcanQ62059 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Vwa3b-205ENSMUST00000162449 1360 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Dcstamp-205ENSMUST00000228556 1684 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Ppih-205ENSMUST00000106321 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Scgb1b7-201ENSMUST00000108097 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VcanQ62059 AC105950.2-201ENSMUST00000220938 368 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Ermard-209ENSMUST00000226561 1019 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Prss23-204ENSMUST00000207932 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Skap2-201ENSMUST00000078214 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
VcanQ62059 A930003A15Rik-201ENSMUST00000100083 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Stard4-202ENSMUST00000118990 648 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
VcanQ62059 1700095A13Rik-201ENSMUST00000185460 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Gm7160-201ENSMUST00000185535 471 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Gm6426-201ENSMUST00000209048 854 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Gm3889-201ENSMUST00000212467 612 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Olfr978-201ENSMUST00000057161 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Aqp7-202ENSMUST00000054945 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Cngb1-204ENSMUST00000121162 3336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Gm22751-201ENSMUST00000102077 109 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Mir692-3-201ENSMUST00000102079 109 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Mir692-2-201ENSMUST00000102081 109 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Apoo-201ENSMUST00000113895 1173 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VcanQ62059 C430039J16Rik-201ENSMUST00000181148 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Sh2d1a-201ENSMUST00000005839 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Gm26440-201ENSMUST00000082591 129 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Gm32072-201ENSMUST00000200803 1434 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VcanQ62059 A830018L16Rik-209ENSMUST00000179089 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
VcanQ62059 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms