Protein–RNA interactions for Protein: Q60596

Xrcc1, DNA repair protein XRCC1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc1Q60596 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
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Xrcc1Q60596 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
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Xrcc1Q60596 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Xrcc1Q60596 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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Xrcc1Q60596 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Xrcc1Q60596 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Xrcc1Q60596 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Xrcc1Q60596 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Xrcc1Q60596 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Xrcc1Q60596 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms