Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Gm7701-201ENSMUST00000163185 1479 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Krtap6-3-202ENSMUST00000185581 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Gm29487-201ENSMUST00000190146 256 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 9230114K14Rik-202ENSMUST00000198720 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Gm44173-201ENSMUST00000204316 132 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Gm45363-201ENSMUST00000210196 1294 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 AC159006.3-201ENSMUST00000226918 664 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Krtap6-3-201ENSMUST00000079151 444 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Vbp1-201ENSMUST00000033540 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Igsf5-201ENSMUST00000000163 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Ighv5-15-201ENSMUST00000103457 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Gm14370-201ENSMUST00000122460 868 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Gm15273-201ENSMUST00000142302 868 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Gm7023-201ENSMUST00000147295 868 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 1700026D11Rik-205ENSMUST00000151417 789 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Actb-207ENSMUST00000167721 1242 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Gm14357-201ENSMUST00000178352 868 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Gm14361-201ENSMUST00000178547 868 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Gm14348-201ENSMUST00000179183 868 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Gm7672-201ENSMUST00000180915 872 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Gm29593-201ENSMUST00000189827 620 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Gm36980-201ENSMUST00000195643 622 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 AC123061.1-201ENSMUST00000228021 999 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Olfr1384-201ENSMUST00000060434 1034 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Gm26440-201ENSMUST00000082591 129 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Esp6-201ENSMUST00000097324 658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Use1-203ENSMUST00000110054 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Gm45591-201ENSMUST00000129058 843 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 1700028K03Rik-202ENSMUST00000159902 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Gm37362-201ENSMUST00000194567 634 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 AC114585.2-201ENSMUST00000227693 486 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Myl10-201ENSMUST00000005611 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Gm25483-201ENSMUST00000083224 227 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Ccm2-203ENSMUST00000109722 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Grin2bQ01097 Snrnp27-201ENSMUST00000001186 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms