Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Cux1-207ENSMUST00000176216 2821 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm29125-201ENSMUST00000187121 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Aqp4P55088 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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