Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PBX2P40425 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PBX2P40425 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PBX2P40425 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PBX2P40425 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PBX2P40425 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PBX2P40425 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PBX2P40425 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PBX2P40425 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PBX2P40425 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PBX2P40425 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PBX2P40425 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PBX2P40425 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PBX2P40425 AC092964.1-201ENST00000623304 1399 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PBX2P40425 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PBX2P40425 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PBX2P40425 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PBX2P40425 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PBX2P40425 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PBX2P40425 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PBX2P40425 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PBX2P40425 AC092295.1-201ENST00000446262 434 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PBX2P40425 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PBX2P40425 AC026412.1-206ENST00000502273 206 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PBX2P40425 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PBX2P40425 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PBX2P40425 ISL1-203ENST00000511384 981 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PBX2P40425 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PBX2P40425 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PBX2P40425 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PBX2P40425 NF1P11-201ENST00000621292 1282 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PBX2P40425 AP003108.4-201ENST00000623917 878 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PBX2P40425 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PBX2P40425 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PBX2P40425 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PBX2P40425 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PBX2P40425 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PBX2P40425 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PBX2P40425 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PBX2P40425 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PBX2P40425 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PBX2P40425 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PBX2P40425 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PBX2P40425 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PBX2P40425 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PBX2P40425 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PBX2P40425 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PBX2P40425 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PBX2P40425 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PBX2P40425 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PBX2P40425 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PBX2P40425 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PBX2P40425 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PBX2P40425 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PBX2P40425 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PBX2P40425 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PBX2P40425 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PBX2P40425 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PBX2P40425 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PBX2P40425 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PBX2P40425 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PBX2P40425 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PBX2P40425 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PBX2P40425 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PBX2P40425 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PBX2P40425 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PBX2P40425 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PBX2P40425 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PBX2P40425 Z82185.1-201ENST00000417792 549 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PBX2P40425 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PBX2P40425 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PBX2P40425 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PBX2P40425 CT45A11P-201ENST00000448043 1134 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PBX2P40425 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PBX2P40425 AC122694.1-201ENST00000510987 563 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PBX2P40425 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PBX2P40425 PRR13-209ENST00000549924 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PBX2P40425 ACTBP9-201ENST00000587663 1099 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PBX2P40425 SMIM8-207ENST00000608525 735 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PBX2P40425 AC006986.1-201ENST00000612764 241 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PBX2P40425 AP001043.1-206ENST00000613045 730 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PBX2P40425 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PBX2P40425 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PBX2P40425 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PBX2P40425 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PBX2P40425 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PBX2P40425 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PBX2P40425 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PBX2P40425 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PBX2P40425 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PBX2P40425 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PBX2P40425 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PBX2P40425 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PBX2P40425 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PBX2P40425 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PBX2P40425 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PBX2P40425 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
PBX2P40425 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PBX2P40425 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PBX2P40425 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms