Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Teddm3-201ENSMUST00000170665 1346 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Ghrl-205ENSMUST00000204163 447 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 AC107752.1-201ENSMUST00000219362 469 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms