Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tgfb1P04202 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.7 ms