Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
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Ccl20O89093 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
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Ccl20O89093 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
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Ccl20O89093 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
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Ccl20O89093 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
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Ccl20O89093 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
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Ccl20O89093 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
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Ccl20O89093 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
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Ccl20O89093 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
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Ccl20O89093 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
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Ccl20O89093 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
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Ccl20O89093 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
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Ccl20O89093 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
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Ccl20O89093 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
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Ccl20O89093 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
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Ccl20O89093 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
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