Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Cir1-201ENSMUST00000058615 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Prrt4B2RU40 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms