Protein–RNA interactions for Protein: Q9D162

Ccdc167, Coiled-coil domain-containing protein 167, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc167Q9D162 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Usp45-202ENSMUST00000065111 6003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Epc1-201ENSMUST00000028100 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Echdc1-201ENSMUST00000020034 3856 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Hmgcr-201ENSMUST00000022176 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Hjurp-201ENSMUST00000054674 4878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Traf3-201ENSMUST00000021706 7060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Sf3b5-201ENSMUST00000105139 3841 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Mfn2-204ENSMUST00000105716 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Trim9-205ENSMUST00000221041 3767 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Ano2-204ENSMUST00000160496 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Pld1-201ENSMUST00000067757 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Spata31d1a-201ENSMUST00000066510 4261 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Lss-201ENSMUST00000048678 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Ccdc186-202ENSMUST00000118592 6445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Limch1-202ENSMUST00000101164 5192 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 A830010M20Rik-208ENSMUST00000211896 5256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Dctn1-204ENSMUST00000113918 4321 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Gm44062-201ENSMUST00000203312 4857 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 Kif1b-203ENSMUST00000060537 10233 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ccdc167Q9D162 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms